◆往路コース概要と記録
＜１区＝２１・４キロ＞
東京・大手町の読売新聞社前から鶴見中継所。前半に新八ツ山橋の上り、後半に新六郷橋の下りがあるが、全体的に平たんコース。区間記録は１時間１分６秒（２００７年＝東海大・佐藤悠基）
＜２区＝２３・２キロ＞
鶴見中継所から戸塚中継所。「花の２区」と呼ばれ各チームのエースがしのぎを削る重要区間。ごぼう抜きが見られる区間で、０９年のダニエル（日大）の２０人抜きは不滅の記録。１０年はスーパールーキー村沢（東海大）が１０人抜きした。１４キロ地点の権太坂、残り３キロの上り坂がポイント。区間記録は１時間６分０４秒（２００９年＝山梨学院大・モグス）
＜３区＝２１・５キロ＞
戸塚中継所から平塚中継所。１０キロ付近まで緩やかな下り坂。浜須賀から海岸沿い（国道１３４号）を走るため海風の影響を受けやすい。正面に富士山、左手に相模湾と一番の景勝地を走る。区間記録は１時間１分４０秒（２００９年＝早大・竹沢健介）
＜４区＝１８・５キロ＞
平塚中継所から小田原中継所。全区間中、もっとも短い。前半は平たんだが、後半は細かなアップダウンが続く。区間記録は５５分０４秒（２００９年＝早大・三田裕介）
＜５区＝２３・４キロ＞
小田原中継所から芦ノ湖畔。箱根湯本駅の先からつづら折りの急こう配の坂を上る「山上り」。標高差は８６４メートル。寒さ対策も鍵を握る。ゴール前５キロ弱は下り。２年連続で柏原（東洋大）が区間新記録をマークしている。区間記録は１時間１７分０８秒（２０１０年＝東洋大・柏原竜二）
◆復路コース概要と記録
＜６区＝２０・８キロ＞
芦ノ湖畔から小田原中継所。午前８時に往路のゴール順にスタート。往路優勝校との差が１０分以上のチームは同１０分に一斉スタートする。５区とは逆に序盤４キロの上りを過ぎると、山を駆け下り続ける過酷なコース。ゴール前３キロはほぼ平たん。区間記録は５８分２１秒（２００１年＝大東大・金子宣隆）
＜７区＝２１・３キロ＞
小田原中継所から平塚中継所。前半はほぼ平たんで、９キロ過ぎからアップダウンが続くコース。気温が上がる時間帯で、ペース配分が難しい。区間記録は１時間２分３５秒（２００８年＝東海大・佐藤悠基）
＜８区＝２１・５キロ＞
平塚中継所から戸塚中継所。シード権争いが激しさを増すつなぎ区間。１６キロ過ぎまでは平たんだが、遊行寺坂が選手を苦しめる。区間記録は１時間４分５秒（１９９７年＝山梨学院大・古田哲弘）
＜９区＝２３・２キロ＞
戸塚中継所から鶴見中継所。スタート直後は下り。起伏が多く、復路のエース区間。ここで抜け出せるかがカギ。区間記録は１時間８分１秒（２００８年＝中央学院大・篠藤淳）
＜１０区＝２３・１キロ＞
鶴見中継所から大手町・読売新聞社前。最終区間。最後のドラマが生まれる。区間記録は１時間８分５９秒（２００７年＝順大・松瀬元太）
